Suomalaisista kauppamerenkulkuun käytettävistä aluksista pidetään alusrekisteriä. Alusrekisteriä pitävät Merenkulkulaitos ja Ahvenanmaan lääninhallitus. Merenkulkulaitos pitää alusrekisteriä muun Suomen osalta ja Ahvenanmaan lääninhallitus vastaa niistä aluksista, joiden kotipaikka on Ahvenanmaan maakunnassa. Nämä viranomaiset käsittelevät myös aluskiinnitysasiat.

Alusrekisterin yhteydessä pidetään alusrakennusrekisteriä sekä alusrekisterilain 2 a luvussa tarkoitettua historiarekisteriä.

Alusten rekisteröinnistä säädetään alusrekisterilaissa (512/1993) ja alusrekisteriasetuksessa (874/1993). Aluksen kansallisuudesta säädetään merilain 1 luvun 1 §:ssä (1302/1999) ja sen soveltamisesta annetussa asetuksessa (1304/1999).